手掌长硬疙瘩按着会痛，可能是以下原因导致：
1.寻常疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，可通过直接或间接接触传播。HPV感染皮肤黏膜后，会在局部增殖，形成赘生物，即寻常疣。寻常疣通常表现为质地较硬的丘疹，表面粗糙，呈乳头样、菜花状或鸡冠样，可单发或多发，颜色可为肤色、灰色、褐色等。寻常疣一般无明显自觉症状，有时可伴有压痛或触痛。
2.鸡眼：主要由于长期机械刺激引起，如长期穿不合适的鞋子、足骨畸形等。鸡眼是由于皮肤长期受到挤压或摩擦，导致角质层增厚，形成圆锥形的角质栓，尖端深入皮内，基底露于外面。鸡眼一般呈黄色或淡黄色，表面光滑，与皮面平或稍隆起，境界清楚，中心有倒圆锥状的角质栓嵌入真皮。鸡眼的尖端压迫真皮内的末梢神经，会引起疼痛。
3.胼胝：又称老茧，是由于皮肤长期受到压迫和摩擦，导致局部角质层增厚。胼胝一般没有明显的症状，也不会引起疼痛，只有在受到外界刺激时，如摩擦、挤压等，才会出现疼痛。
4.腱鞘囊肿：是一种发生于关节部腱鞘内的囊性肿物，是由于关节囊、韧带、腱鞘中的结缔组织退变所致。腱鞘囊肿好发于手腕、手指、足背等部位，可单发或多发，一般不会引起疼痛，只有在囊肿较大、压迫周围组织时，才会出现疼痛、酸胀、无力等症状。
5.其他：手掌长硬疙瘩按着会痛，还可能是其他原因引起的，如皮肤纤维瘤、脂肪瘤、表皮样囊肿等。
针对手掌长硬疙瘩按着会痛的情况，建议及时就医，明确诊断，并根据具体情况进行相应的治疗。