三个月宝宝有痰咳不出来，可采取以下方法帮助排痰：
1.拍背法：让宝宝侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。每侧拍3~5分钟，每天2~3次。
2.脚底按摩：如果宝宝出现咳嗽的症状，家长可以在晚上睡觉前，用热水给宝宝泡脚，水凉了适当再加一些热水，泡15~30分钟即可，然后给宝宝搓脚心，每只脚搓30~50下，两只脚都搓完后，宝宝就会出汗，咳嗽的症状会明显减轻。
3.水蒸气止咳法：将沸水倒入直径10厘米左右的容器中，抱起宝宝，让其口鼻对着水蒸气吸入，可使痰液变稀利于咳出，还可减轻气管与支气管黏膜的充血和水肿，减少咳嗽。但要注意防止烫伤宝宝。
4.药物法：在医生的指导下给宝宝服用止咳化痰的药物，如氨溴索、氨溴特罗等。
需要注意的是，如果宝宝咳嗽咳痰的症状持续不缓解或加重，应及时就医，以免延误病情。同时，要给宝宝多喝水，保持室内空气流通，避免烟雾等刺激。