三个月宝宝喉咙有痰咳不出，可采取以下方法：
1.拍背：让宝宝侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。每侧拍3~5分钟，每天拍2~3次。拍背法不仅能促使宝宝肺部和支气管内的痰液松动，向大气管引流并排出，而且可促进心脏和肺部的血液循环，有利于支气管炎症的吸收。
2.多喝温热的水：温热的水可使黏痰变得稀薄，缓解呼吸道黏膜的紧张状态，促进痰液咳出。此外，凉开水还能改善血液循环，使机体代谢所产生的废物或毒素迅速从尿中排出，从而减轻其对呼吸道的刺激。
3.蒸汽法：将沸水倒入大口杯子，让宝宝口鼻对着升起的水蒸气并吸放，可使痰液变稀利于咳出，还可减轻气管与支气管黏膜的充血和水肿，减少咳嗽。但千万要小心烫伤，避免发生意外。
4.药物法：在医生的指导下，选择氯化铵、桔梗、远志等祛痰药，也可使用氨溴索、乙酰半胱氨酸等化痰药。但要注意药物的副作用和不良反应，避免滥用药物。
需要注意的是，如果宝宝咳嗽咳痰的症状持续加重或出现其他异常表现，如呼吸急促、喘息、发热等，应及时就医，以免延误病情。同时，家长应保持室内空气清新，避免烟雾、粉尘等刺激，让宝宝多休息，有助于身体恢复。