长时间玩手机头疼的原因主要有以下几点：
1.眼睛疲劳：手机屏幕较小，字体较小，长时间盯着手机会导致眼睛疲劳，进而引起头疼。
2.颈部肌肉紧张：长时间低头玩手机会使颈部肌肉紧张，牵拉头部的肌肉，引起头疼。
3.大脑缺氧：手机使用过程中，大脑会高度集中，从而导致大脑缺氧，引起头疼。
4.内分泌紊乱：长时间玩手机会影响人体的正常生物钟，导致内分泌紊乱，从而引起头疼。
5.心理因素：玩手机时间过长，可能会导致心理压力增加，引起头疼。
针对以上原因，可以采取以下措施来缓解头疼：
1.注意休息：每隔一段时间，就要停下来，放松眼睛和颈部肌肉，可以做一些简单的颈部运动或远眺。
2.保持良好的姿势：使用手机时，要保持正确的姿势，不要低头或仰头，眼睛与手机屏幕保持平行。
3.增加户外活动：多参加户外活动，呼吸新鲜空气，有助于缓解大脑缺氧。
4.合理安排时间：控制玩手机的时间，避免过度使用手机，保持规律的作息时间。
5.放松心情：可以通过听音乐、冥想等方式来放松心情，缓解压力。
如果头疼症状严重，或者持续时间较长，建议及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。