六岁小孩半夜发烧39°C是一种常见症状，可能由感染、免疫系统问题或其他原因引起。以下是一些应对建议：
1.测量体温：使用体温计测量孩子的体温。如果体温确实为39°C或更高，需要采取措施降低体温。
2.服用退烧药：可以按照医生或药品说明书的建议给孩子服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚。注意按照正确的剂量使用，并遵循药品说明书上的用药时间间隔。
3.保持水分摄入：发烧会导致孩子出汗，可能会引起脱水。确保孩子摄入足够的水分，可以多喝水或饮用适量的果汁、口服补液盐水。
4.松解衣物：确保孩子穿着宽松、轻便的衣物，避免过多的衣物过热。
5.物理降温：可以用温水擦拭孩子的额头、颈部、腋窝和腹股沟等部位，帮助降低体温。但不要使用酒精或冷水擦拭。
6.观察症状：密切观察孩子的症状，如是否有咳嗽、流鼻涕、喉咙痛、皮疹等。如果症状加重或持续不缓解，或孩子出现其他异常症状，应及时就医。
7.就医咨询：如果孩子的体温持续较高或出现其他严重症状，如呼吸急促、意识不清、抽搐等，应立即就医或拨打急救电话。医生会根据孩子的具体情况进行进一步的诊断和治疗。
需要注意的是，以上建议仅为一般情况下的应对措施。如果对孩子的健康状况有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的意见。此外，定期带孩子进行体检，预防接种，保持良好的卫生习惯，也有助于预防感染和疾病的发生。