早上起床咳得厉害的原因可能有以下几种：
1.呼吸道感染：病毒或细菌感染呼吸道可引起咳嗽，常见于感冒、流感、肺炎等疾病。此外，过敏、空气污染等也可能导致呼吸道炎症，引起咳嗽。
2.咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，主要表现为咳嗽，常在夜间或清晨发作，运动、冷空气等可诱发咳嗽。
3.鼻后滴注综合征：鼻腔分泌物倒流刺激咽喉部可引起咳嗽，常伴有鼻塞、流涕等症状。
4.胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和咽喉部可引起咳嗽，常伴有烧心、反酸等症状。
5.其他原因：如慢性阻塞性肺疾病、心功能不全、药物副作用等也可能导致咳嗽。
如果咳嗽持续时间较长或伴有其他症状，如呼吸困难、胸痛、发热等，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸片、肺功能等，以明确病因，并进行针对性治疗。此外，保持室内空气湿润、避免吸烟等也有助于缓解咳嗽症状。