早上起来咳嗽厉害的原因可能是：
1.上呼吸道感染：夜间睡眠时，呼吸道分泌物会积聚在喉咙和气管中，早上起床后，通过咳嗽可以将这些分泌物排出体外，因此会出现咳嗽厉害的情况。
2.咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，主要表现为刺激性干咳，通常在夜间和凌晨发作或加重。
3.鼻后滴注综合征：如果患有鼻炎或鼻窦炎，鼻腔分泌物可能会倒流到喉咙，刺激咳嗽感受器，引起咳嗽。
4.胃食管反流病：胃酸反流到食管和喉咙，刺激咳嗽感受器，也会引起咳嗽。
5.其他原因：如过敏、药物副作用、肺动脉高压等。
如果咳嗽持续时间较长或伴有其他症状，如呼吸困难、喘息、发热等，建议及时就医，进行相关检查和治疗。同时，保持室内空气湿润、避免吸烟等也有助于缓解咳嗽症状。