三个月宝宝鼻塞、咳嗽、打喷嚏，可采取以下方法处理。
1.清理鼻腔：使用生理性海盐水滴鼻或喷鼻，软化、稀释鼻涕后，使用吸鼻器吸出分泌物。
2.改变体位：经常改变宝宝的体位，左侧鼻塞时右侧卧，右侧鼻塞时左侧卧，可缓解鼻塞。
3.局部热敷：用温热的湿毛巾轻敷宝宝的鼻部，注意温度不要过高，避免烫伤。
4.补充水分：适当增加宝宝的水分摄入，有助于缓解鼻塞和咳嗽。
5.远离过敏原：如果怀疑宝宝对某种物质过敏，应尽量避免接触，如花粉、宠物毛发等。
6.保持室内湿度：使用加湿器增加室内湿度，有助于缓解宝宝的鼻塞和咳嗽。
7.观察病情：注意观察宝宝的症状是否加重，如出现呼吸急促、喘息、发热等，应及时就医。
8.就医治疗：如果宝宝的症状持续不缓解或加重，或者出现其他异常情况，应及时就医，医生可能会根据具体情况给予药物治疗。
需要注意的是，不建议自行给宝宝使用药物，尤其是抗生素。在使用任何药物之前，最好先咨询医生的意见。同时，要保持宝宝的鼻腔清洁和湿润，避免宝宝接触过敏原，注意保持室内空气流通和适当的温度。如果宝宝的症状持续时间较长或出现其他异常情况，应及时就医。