三个月的宝宝有痰，可能是生理现象，也可能是疾病引起。以下是一些建议：
1.观察宝宝的情况：如果宝宝精神状态好，吃奶正常，没有咳嗽、呼吸急促等症状，可能是生理现象，不需要特殊处理。可以适当给宝宝喂一些水，帮助稀释痰液。
2.保持室内空气湿润：可以使用加湿器增加室内空气湿度，有助于缓解宝宝喉咙中的痰液。
3.拍背排痰：将宝宝竖着抱起，空心掌由下往上，由外向内拍背，有助于痰液松动，促进排出。
4.及时就医：如果宝宝出现咳嗽、呼吸急促、吃奶差等症状，可能是疾病引起，需要及时就医。医生可能会根据宝宝的具体情况，给予药物治疗或其他治疗措施。
需要注意的是，不要自行给宝宝使用药物，尤其是抗生素。如果对宝宝的情况有任何疑问，最好咨询医生的意见。