三个月的宝宝有痰，可能是正常的生理现象，也可能是疾病引起的。以下是一些应对方法：
1.观察宝宝的情况：如果宝宝精神状态良好，能吃能睡，呼吸平稳，只是偶尔有痰，可能不需要特殊处理。但如果宝宝出现咳嗽、呼吸急促、发热等症状，或者痰的颜色异常（如变黄、变绿），应及时就医。
2.保持室内空气湿润：可以使用加湿器增加室内空气湿度，有助于缓解宝宝喉咙的不适。
3.拍背排痰：让宝宝侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打宝宝的背部，由上而下，从外向内，依次进行。拍背时要有一定的力度，震动气道，才能使痰液松动易于排出。每次拍背5~10分钟，每天拍2~3次。
4.多喂水：水能稀释痰液，使痰更容易咳出。如果宝宝愿意，可以给他喝一些温水。
5.就医治疗：如果宝宝的痰比较多，或者经过以上处理后症状没有缓解，医生可能会建议使用一些祛痰药物，如氨溴索、乙酰半胱氨酸等。这些药物可以降低痰液的黏度，使痰液更容易咳出。此外，医生还可能会根据宝宝的具体情况进行雾化治疗、吸痰等。
需要注意的是，三个月的宝宝还比较小，身体各器官的功能尚未完全发育成熟，因此在处理宝宝的痰液问题时，要特别小心。如果对宝宝的情况有任何疑虑，最好咨询医生的意见。同时，在给宝宝用药时，要严格按照医生的建议使用，不要自行增减剂量或更换药物。
以上内容仅供参考，如果有相关需求，建议及时咨询专业医生。