长时间看手机眼睛疼可能是视疲劳、干眼症、结膜炎等引起的，可采取以下措施。
1.闭目休息：长时间看手机后，应闭目休息5~10分钟，也可以眺望远方或做眼保健操，使眼睛得到充分的放松。
2.调整手机亮度：手机屏幕过亮或过暗都可能对眼睛造成刺激，导致眼睛疼痛。应调整手机屏幕的亮度，使其柔和且不刺眼。
3.保持正确的用眼姿势：看手机时应保持正确的用眼姿势，眼睛与手机的距离应适中，一般为30~40厘米。同时，不要在晃动的环境中看手机，以免加重眼睛的疲劳感。
4.局部热敷：用热毛巾或蒸汽眼罩敷在眼睛上，每次15~20分钟，可促进眼部血液循环，缓解眼睛疼痛。
5.人工泪液：如果眼睛干涩疼痛，可以使用人工泪液滴眼，如玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等，以缓解症状。
6.就医诊治：如果眼睛疼痛持续不缓解，或伴有其他症状，如视力下降、眼红、分泌物增多等，可能是眼部疾病引起的，应及时就医诊治。
需要注意的是，长时间看手机不仅会导致眼睛疼痛，还可能引起近视、干眼症等眼部疾病。因此，应控制看手机的时间，避免长时间用眼。如果出现眼部不适，应及时采取措施缓解，同时注意眼部卫生，避免用手揉眼睛。