3周岁宝宝身高才90厘米，可能是以下原因引起的。
1.遗传因素：宝宝的身高受到遗传因素的影响较大。如果父母身高较矮，宝宝可能也会偏矮。
2.营养因素：宝宝的营养状况对身高发育也有重要影响。如果宝宝摄入的营养不足，如蛋白质、维生素、矿物质等，可能会影响身高的增长。
3.疾病因素：某些疾病也可能导致宝宝身高发育迟缓，如生长激素缺乏症、甲状腺功能减退症等。
4.运动因素：适当的运动可以刺激骨骼生长，有助于宝宝身高的增长。
5.睡眠因素：宝宝的睡眠质量和时间对身高发育也有影响。充足的睡眠可以促进生长激素的分泌。
如果发现宝宝身高明显低于同龄人，建议及时带宝宝到医院就诊，进行全面的检查和评估，以确定原因并采取相应的措施。同时，家长也可以注意以下几点，有助于宝宝身高的增长。
1.保证营养均衡：给宝宝提供丰富多样的食物，包括蛋白质、维生素、矿物质等，确保宝宝摄入足够的营养。
2.适当运动：让宝宝进行适量的运动，如户外活动、游泳等，可以促进骨骼生长。
3.保证充足睡眠：培养宝宝良好的睡眠习惯，保证充足的睡眠时间。
4.定期体检：按照医生的建议定期带宝宝进行体检，及时发现问题并进行干预。