三个月宝宝睡觉老是摇头蹬腿，可能是正常的生理现象，也可能与维生素D缺乏性佝偻病、湿疹等有关。以下是一些可能的原因和建议：
1.正常的生理现象：
神经系统发育不完善：三个月的宝宝神经系统发育还不完善，大脑皮层兴奋性较低，容易出现睡觉时摇头蹬腿的现象。
浅睡眠状态：宝宝在浅睡眠时，也可能会出现摇头蹬腿、哼哼唧唧等动作，这是正常的生理现象，通常不需要特殊处理。
2.维生素D缺乏性佝偻病：
病因：维生素D缺乏性佝偻病是由于维生素D摄入不足或缺乏导致钙磷代谢紊乱，引起的一种全身性疾病。宝宝如果长期维生素D摄入不足，会导致钙吸收减少，引起神经兴奋性增高，出现多汗、摇头、烦躁、睡眠不安等症状。
治疗方法：及时补充维生素D和钙剂，多晒太阳，增加户外活动。
3.湿疹：
病因：湿疹是一种常见的皮肤炎症，与过敏、遗传、环境等因素有关。宝宝如果患有湿疹，会出现皮肤瘙痒、疼痛等症状，睡觉时可能会通过摇头蹬腿来缓解不适。
治疗方法：保持皮肤清洁干燥，避免搔抓，避免接触过敏原，根据湿疹的严重程度选择合适的药物治疗。
如果宝宝睡觉摇头蹬腿的情况比较严重，或者伴有其他异常症状，如哭闹、多汗、夜惊、肋骨外翻等，建议及时就医，明确原因，以便采取相应的治疗措施。同时，家长也要注意给宝宝提供舒适的睡眠环境，保持室内温度适宜、空气流通，避免过度包裹。