三个月宝宝睡觉老是摇头蹬腿，可能是正常的生理现象，也可能与维生素D缺乏、湿疹等有关。以下是一些可能的原因和建议：
1.生理因素：
神经系统发育不完善：宝宝的神经系统尚未完全发育成熟，容易出现兴奋和不自主的运动，包括摇头、蹬腿等。
浅睡眠状态：宝宝在浅睡眠时，可能会出现一些小动作，如摇头、微笑、皱眉等，这是正常的生理现象。
温度不适：如果宝宝睡觉时过热或过冷，可能会感到不舒服，从而通过摇头、蹬腿等方式来调整。
环境因素：噪音、光线等环境因素可能会影响宝宝的睡眠，导致他们通过摇头、蹬腿等方式来表达不满。
2.维生素D缺乏：维生素D缺乏可能导致宝宝神经兴奋性增加，出现多汗、摇头、烦躁、睡眠不安等症状。此外，宝宝多汗时，头部与枕头摩擦也会导致摇头。
3.湿疹：湿疹会导致皮肤瘙痒，宝宝会通过摇头、蹬腿等方式来缓解瘙痒。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.调整睡眠环境：保持适宜的温度和湿度，避免噪音和光线的刺激。
2.注意皮肤护理：保持宝宝皮肤清洁干燥，勤换衣物和床单，避免过度摩擦。
3.适当补充维生素D：如果宝宝缺乏维生素D，应在医生的指导下进行补充。
4.观察宝宝的情况：如果宝宝除了摇头、蹬腿外，还伴有其他异常症状，如哭闹、呕吐、腹泻等，应及时就医，以排除其他疾病的可能。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，如果家长对宝宝的睡眠问题感到担忧，最好咨询医生的意见，以便获得更专业的建议和诊断。同时，家长应密切关注宝宝的生长发育情况，如有异常应及时就医。