三个月的宝宝拉肚子，可能是正常的生理现象，也可能是由疾病引起的。如果宝宝精神状态良好，生长发育正常，可能是生理性腹泻，不需要特殊处理。如果宝宝精神状态差，食欲不振，或者有其他异常症状，可能是病理性腹泻，需要及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
以下是一些可能导致宝宝拉肚子的原因和建议：
1.生理性腹泻：宝宝消化系统发育不成熟，胃酸和消化酶分泌少，酶活力偏低，不能适应食物质和量的较大变化，容易引起腹泻。此外，母乳喂养的宝宝，大便次数也会较多，而且质地较稀薄，其中有较多的泡沫，有酸味。宝宝精神状态好，体重正常增加，属于正常现象，不需要特殊治疗。随着宝宝的生长，消化功能逐渐完善，这种情况会逐渐改善。
2.乳糖不耐受：有些宝宝体内缺乏乳糖酶，无法消化母乳或牛奶中的乳糖，会导致腹泻。可以在医生的指导下，给宝宝补充乳糖酶，或者改吃无乳糖奶粉。
3.过敏：宝宝对牛奶、鸡蛋、海鲜等食物过敏，也会引起腹泻。需要及时带宝宝去医院检查过敏原，并避免接触过敏原。
4.感染：宝宝感染了病毒、细菌、真菌等病原体，也会导致腹泻。常见的病原体有轮状病毒、诺如病毒、大肠杆菌等。需要及时带宝宝去医院检查大便常规和轮状病毒等，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
5.其他：宝宝腹部受凉、饮食不当、药物副作用等也可能导致腹泻。需要注意宝宝的腹部保暖，避免食用生冷、油腻、刺激性食物，按照医生的建议使用药物。
总之，宝宝三个月拉肚子，需要密切观察宝宝的精神状态、饮食情况、尿量等，如果症状持续不缓解或者出现其他异常症状，需要及时就医。同时，要注意给宝宝补充水分和电解质，防止脱水。