扁桃体发炎主要是由病原微生物感染引起，其中最常见的是乙型溶血性链球菌，约占病原体的30%左右。此外，葡萄球菌、肺炎链球菌等细菌，以及腺病毒、鼻病毒等病毒也可导致扁桃体发炎。
感染因素导致扁桃体发炎
细菌感染： 像A组乙型溶血性链球菌是引发扁桃体炎很常见的细菌因素。这种细菌常常在人体抵抗力下降时乘虚而入，比如当过度劳累、天气寒冷变化时，人体免疫力降低，细菌就容易侵犯扁桃体，引发炎症反应。另外，葡萄球菌也是导致扁桃体发炎的细菌之一，它可以直接感染扁桃体组织，使得扁桃体出现红肿、疼痛等发炎症状。病毒感染： 腺病毒是引起扁桃体发炎的常见病毒。腺病毒感染具有一定的传染性，可通过飞沫、接触等方式传播。儿童相对更容易受到腺病毒的侵袭而引发扁桃体发炎。还有鼻病毒，它也能感染扁桃体，引发炎症，导致扁桃体出现充血、肿大等情况。
免疫力因素引发扁桃体发炎
当人体自身免疫力低下时，就容易遭受病原体的侵袭。比如儿童的免疫系统还在发育阶段，相对较弱，所以儿童比成年人更容易发生扁桃体发炎。老年人随着年龄增长，免疫力也会逐渐下降，同样容易受到病原微生物的感染而出现扁桃体发炎的情况。还有长期营养不良、过度劳累、长期处于不良环境中的人，他们的免疫力都会受到影响，进而增加扁桃体发炎的风险。
邻近器官炎症蔓延导致扁桃体发炎
当邻近的器官发生炎症时，炎症可能会蔓延到扁桃体引发发炎。例如咽炎，如果咽部的炎症没有得到及时有效的控制，炎症就有可能向周围组织扩散，波及到扁桃体，引起扁桃体发炎。还有鼻炎，鼻腔的炎症如果累及到咽部，也可能通过咽鼓管等途径影响到扁桃体，导致扁桃体出现炎症反应，出现红肿、疼痛等症状。