怀孕三个月肚子隐隐作痛，可能是以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长。在这个过程中，子宫可能会出现拉扯感或隐隐作痛，这是正常的生理现象。
2.子宫收缩：怀孕早期，子宫可能会出现不规则的收缩，称为假性宫缩。这些收缩通常不会引起流产，但可能会导致肚子隐隐作痛。
3.韧带拉伸：怀孕后，身体内的激素水平会发生变化，这可能会导致韧带拉伸和松弛。韧带拉伸可能会引起肚子隐隐作痛，尤其是在子宫增大时。
4.其他原因：除了上述原因外，肚子隐隐作痛还可能与其他因素有关，如消化不良、肠道问题、膀胱炎等。
如果肚子隐隐作痛不严重，没有阴道出血等异常情况，可以先观察一下。注意休息，避免剧烈运动和性生活。如果疼痛持续加重或伴有阴道出血等异常情况，应及时就医，进行详细的检查和治疗。
在怀孕期间，应注意以下事项：
1.注意休息，避免过度劳累。
2.保持良好的心态，避免紧张和焦虑。
3.注意饮食卫生，避免食用不洁食物。
4.避免接触有害物质，如化学物质、辐射等。
5.按照医生的建议进行产前检查，及时了解胎儿的发育情况。