三个月宝宝睡觉老是摇头，可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.生理原因：
头部出汗：宝宝头部容易出汗，尤其是在炎热的天气或睡觉时，出汗会导致头部瘙痒，从而使宝宝摇头。
湿疹：湿疹是一种常见的皮肤问题，可能会出现在宝宝的头部、脸部、颈部等部位。湿疹会导致皮肤瘙痒，使宝宝感到不舒服，从而摇头。
皮肤干燥：宝宝的皮肤娇嫩，如果皮肤过于干燥，也会引起瘙痒，导致宝宝摇头。
2.环境原因：
温度过高：如果宝宝所处的环境温度过高，或者宝宝穿着过多的衣物，会导致宝宝出汗过多，从而引起摇头。
噪音：噪音过大或过于嘈杂的环境会影响宝宝的睡眠质量，使宝宝感到不安，从而摇头。
光线：过于明亮的光线会刺激宝宝的眼睛，影响宝宝的睡眠，使宝宝摇头。
3.心理原因：
情绪紧张：宝宝在睡觉前可能会感到紧张、焦虑或兴奋，这些情绪会导致宝宝摇头。
缺乏安全感：宝宝在睡觉时如果感到缺乏安全感，也会通过摇头来寻找安慰。
4.疾病原因：
中耳炎：中耳炎是一种常见的耳部疾病，会导致耳部疼痛，使宝宝感到不舒服，从而摇头。
佝偻病：佝偻病是一种由于维生素D缺乏导致的疾病，会导致宝宝骨骼发育异常，从而引起摇头。
其他：其他可能导致宝宝睡觉摇头的疾病还包括湿疹、过敏等。
如果宝宝睡觉老是摇头，家长可以采取以下措施：
1.保持宝宝头部清洁：经常给宝宝洗头，保持头部清洁干燥。
2.注意环境温度和湿度：保持宝宝所处环境的温度和湿度适宜，避免宝宝出汗过多或皮肤过于干燥。
3.保持安静：给宝宝提供一个安静、舒适的睡眠环境，避免噪音和光线的刺激。
4.注意宝宝的穿着：给宝宝穿着宽松、舒适的衣物，避免穿着过多或过少。
5.给予宝宝安全感：在宝宝睡觉前，可以给宝宝一个安抚奶嘴、拥抱或轻拍，让宝宝感到安全和舒适。
6.观察宝宝的其他症状：如果宝宝除了睡觉摇头外，还伴有其他症状，如发热、咳嗽、腹泻等，应及时带宝宝就医，以便明确病因并进行治疗。
需要注意的是，如果宝宝睡觉摇头的情况持续时间较长或伴有其他异常症状，家长应及时带宝宝就医，以便明确病因并进行治疗。同时，家长应注意观察宝宝的情况，如有异常应及时就医。