小儿佝偻病主要是由于维生素D缺乏引起的，约90%的小儿佝偻病与维生素D不足有关。
维生素D摄入不足
母乳中维生素D含量低： 母乳中维生素D的含量相对较低，如果婴儿仅以母乳喂养且户外活动少，就容易缺乏维生素D。一般来说，母乳中维生素D的含量约为10~80IU/L，单纯母乳喂养的婴儿如果不及时补充维生素D，3个月左右就可能出现维生素D缺乏的情况。配方奶中维生素D添加不足： 虽然配方奶中会添加维生素D，但如果配方奶中维生素D添加量不足，也不能满足小儿生长发育的需求。通常配方奶中维生素D的添加量需符合相关标准，若低于标准量，小儿就有患佝偻病的风险。
日照不足
户外活动少： 小儿如果很少进行户外活动，皮肤接触阳光的机会就少。皮肤中的7-脱氢胆固醇需要经紫外线照射转化为维生素D，每天保证1~2小时的户外活动，才能满足身体对维生素D的部分需求。如果小儿大部分时间待在室内，比如每天户外活动时间不足30分钟，就容易导致维生素D合成不足。季节因素影响： 在冬季，日照时间短、强度弱，小儿皮肤合成维生素D的量会明显减少。例如在北方地区，冬季日照时间可能不足2小时/天，这会使小儿体内维生素D水平降低，增加患佝偻病的可能性。
生长速度过快
婴幼儿期生长迅猛： 小儿在婴幼儿期生长发育速度非常快，尤其是3个月以内的婴儿，体重和身高增长迅速，对维生素D和钙的需求量增加。如果不能及时补充足够的维生素D和钙，就容易发生佝偻病。比如，一个正常足月儿，出生后前3个月体重每月约增长700~800克，身高每月约增长3.5~4厘米，快速的生长使得身体对维生素D的需求大幅上升。早产儿、双胎儿更易缺乏： 早产儿由于在母体内储存的维生素D较少，出生后生长又比足月儿更快，所以更容易出现维生素D缺乏。双胎儿的生长速度比单胎儿更快，对维生素D和钙的需求也更多，如果补充不及时，也容易患佝偻病。