肛门里面疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
2.肛窦炎：肛窦开口向上，易积存粪便引起感染，导致肛窦炎。炎症刺激可引起肛门部坠痛，肛管直肠周围脓肿：是肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，脓肿破溃或切开引流后常形成肛瘘。
3.肛管直肠周围脓肿：是肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，脓肿破溃或切开引流后常形成肛瘘。
4.外痔发炎：自觉肛门部灼痛、湿痒，便后或活动过多后症状加重。
5.内痔嵌顿：以胀痛、灼痛为主，多由于痔静脉曲张、血络破损、血栓形成，造成组织循环受限而脱出肛门外，无法回纳，好发于40岁以上的中老年人。
6.直肠癌：肛门持续疼痛，且伴有肛门下坠感，大便次数增多，呈黏液便，便意不尽。晚期有脓血便和恶臭分泌物。
如果肛门里面疼持续时间较长或伴有其他症状，如发热、便血、便秘等，建议及时就医，以便明确诊断并进行相应的治疗。