小孩早上起床咳嗽可能由多种原因引起，比如环境因素、呼吸道疾病等。一般来说，常见原因包括以下几方面。
环境因素导致
空气干燥： 如果室内空气湿度较低，低于40%~60%的适宜范围，早上起床时干燥的空气刺激小孩呼吸道，就容易引起咳嗽。比如冬季使用暖气或空调时，若不注意加湿，很可能出现这种情况。过敏原刺激： 床上用品如果没有及时清洁，可能滋生尘螨，早上小孩接触到尘螨等过敏原，会引发呼吸道的过敏反应，导致咳嗽。另外，如果室内有宠物，宠物的毛发、皮屑等也可能成为过敏原，引起小孩早上咳嗽。
呼吸道疾病相关
上呼吸道感染恢复期： 小孩之前患过上呼吸道感染，虽然病情有所好转，但呼吸道黏膜仍处于修复阶段，早上气道可能比较敏感，容易出现咳嗽。一般感染后的1~2周内可能会有这种残留的咳嗽表现。鼻炎： 小孩患有鼻炎时，鼻腔分泌物会在夜间倒流至咽喉部，早上起床后体位改变，分泌物刺激呼吸道，就会引起咳嗽。尤其是过敏性鼻炎的小孩，症状可能更明显，还可能伴有鼻塞、流涕等症状。支气管炎： 小孩患有支气管炎时，支气管黏膜存在炎症，早上气温相对较低，加上气道内可能有少量分泌物，刺激支气管引发咳嗽。通常还会伴有咳痰等症状，听诊时能听到肺部有啰音。
胃食管反流因素
婴幼儿胃食管反流： 对于月龄较小的婴儿，由于食管下括约肌发育不完善，容易出现胃食管反流。晚上平卧时，胃内容物可能反流至食管，早上起床后体位变化，刺激咽喉部引起咳嗽。一般随着年龄增长，食管下括约肌功能逐渐完善，这种情况会有所改善。