睡觉起来肩膀疼，可能与以下原因有关。
1.不良睡姿
枕头高度不合适、床垫过软或过硬，可能导致睡觉时肩膀受压，引起疼痛。
睡觉时长期保持一个姿势，如侧睡时手臂受压、俯睡时肩膀悬空，也可能导致肩膀疼痛。
2.肩部疾病
肩周炎：又称粘连性肩关节囊炎，是一种常见的肩部疾病，主要表现为肩关节疼痛、活动受限。肩周炎可能导致睡觉起来后肩膀疼痛。
肩袖损伤：肩袖是肩关节周围的一组肌腱和韧带，肩袖损伤可能导致肩膀疼痛、无力。
其他肩部疾病：如肩关节滑膜炎、肱二头肌长头肌腱炎等，也可能引起睡觉起来后肩膀疼痛。
3.颈部疾病
颈椎病：颈椎间盘突出、颈椎管狭窄等颈椎病可能压迫神经根，导致肩部疼痛。
颈部肌肉劳损：长期低头、伏案工作等可能导致颈部肌肉劳损，睡觉时也可能出现肩膀疼痛。
4.其他原因
外伤：肩部受到外伤，如扭伤、拉伤等，可能导致肩膀疼痛。
感染：肩部感染，如细菌感染、病毒感染等，也可能引起肩膀疼痛。
系统性疾病：如类风湿关节炎、强直性脊柱炎等系统性疾病，也可能累及肩部，导致疼痛。
如果睡觉起来后肩膀疼痛持续不缓解，或伴有其他症状，如手臂麻木、无力、颈部疼痛等，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因，并采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、老年人、患有基础疾病的人群等，睡觉时更要注意保持正确的姿势，选择合适的床垫和枕头，避免肩膀受压。如果出现肩膀疼痛，应及时就医，避免自行用药或采取不当的治疗方法。同时，定期进行肩部的保健和锻炼，如适量的肩部运动、按摩等，有助于预防肩部疾病的发生。