两侧肩膀酸疼可能是肩周炎、肩袖损伤、颈椎病、心脏疾病等原因所致，可以通过一般治疗、药物治疗、物理治疗、手术治疗等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.肩周炎：又称五十肩、冻结肩，是肩关节周围炎的简称。肩周炎可能与肩部急性挫伤、牵拉伤后治疗不当、肩部急性感染、颈椎病等有关。肩周炎患者主要表现为肩关节周围疼痛，夜间加重，影响睡眠，肩关节各个方向的活动均受限，梳头、穿衣、洗脸等日常生活动作均难以完成。肩周炎的治疗主要包括一般治疗、药物治疗、物理治疗、中医治疗、手术治疗等。
2.肩袖损伤：肩袖损伤是指肩袖肌腱和（或）肩峰下滑囊的慢性损伤性炎症。肩袖损伤的主要原因包括创伤、过度使用、肩部疾病等。肩袖损伤的主要表现为肩关节疼痛和无力，疼痛在夜间加重，可向上臂、颈部放射，肩关节活动受限，以外展、外旋、上举等动作最为明显。肩袖损伤的治疗主要包括保守治疗和手术治疗。保守治疗包括休息、制动、物理治疗、药物治疗等，适用于损伤较轻的患者。手术治疗适用于损伤较重、保守治疗无效的患者。
3.颈椎病：颈椎病是一种以退行性病理改变为基础的疾病，主要由于颈椎长期劳损、骨质增生，或椎间盘脱出、韧带增厚，致使颈椎脊髓、神经根或椎动脉受压，出现一系列功能障碍的临床综合征。颈椎病可分为神经根型颈椎病、脊髓型颈椎病、椎动脉型颈椎病、交感神经型颈椎病等。不同类型的颈椎病，其症状也有所不同。神经根型颈椎病的主要表现为颈肩痛、上肢放射痛、手指麻木、无力等；脊髓型颈椎病的主要表现为四肢麻木、无力、行走困难等；椎动脉型颈椎病的主要表现为头晕、头痛、恶心、呕吐、猝倒等；交感神经型颈椎病的主要表现为头晕、头痛、恶心、呕吐、心动过速、血压升高等。颈椎病的治疗主要包括保守治疗和手术治疗。保守治疗包括休息、牵引、理疗、药物治疗等，适用于症状较轻的患者。手术治疗适用于症状较重、保守治疗无效的患者。
4.心脏疾病：心脏疾病也可能导致两侧肩膀酸疼，如心肌梗死、心绞痛等。心肌梗死是指因冠状动脉出现急性阻塞，心脏肌肉因缺乏血液供应出现坏死，使心脏功能受损的一种可能危及生命的急性病症。心绞痛则是由于心肌缺血、缺氧引起的胸部不适或疼痛。这两种情况都可能导致肩部、左臂甚至背部出现疼痛。
患者在治疗期间需要注意休息，避免过度劳累，可适当食用富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡肉、鱼肉、蔬菜、水果等，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品等。