萎缩性胃炎与非萎缩性胃炎的主要区别在于胃黏膜是否发生萎缩性改变。
非萎缩性胃炎是指不伴有胃黏膜萎缩性改变、胃黏膜层见以淋巴细胞和浆细胞为主的慢性炎症细胞浸润的慢性胃炎。根据病变分布，可再分为胃窦胃炎、胃体胃炎、全胃炎（以胃窦为主）或全胃炎（以胃体为主）。
萎缩性胃炎是指胃黏膜已发生萎缩性改变的慢性胃炎，常伴有肠化生。根据病变分布，也可再分为胃窦胃炎、胃体胃炎、全胃炎。
此外，萎缩性胃炎还可分为多灶萎缩性胃炎和自身免疫性胃炎两大类。自身免疫性胃炎以富含壁细胞的胃体黏膜萎缩为主，患者血液中存在自身抗体，如壁细胞抗体、内因子抗体等。