小儿高烧39度反复发作的原因可能有很多，如感染、免疫系统问题、其他潜在疾病等。需要进一步检查和评估以确定具体原因。
1.感染：如病毒、细菌、支原体等感染，呼吸道感染、胃肠道感染等都可能导致高烧反复发作。
2.免疫系统问题：免疫系统异常可能导致小儿容易感染，出现高烧反复发作的情况。
3.其他潜在疾病：如血液疾病、自身免疫性疾病、恶性肿瘤等也可能引起高烧。
针对小儿高烧反复发作的情况，建议采取以下措施：
1.及时就医：咨询医生，进行详细的身体检查和必要的实验室检查。
2.遵循医生的治疗建议：医生可能会根据具体情况开具退烧药、抗生素等药物，并告知如何正确使用。
3.注意护理：保持小儿的水分摄入，多喝水或口服补液盐，避免过度捂热，注意休息。
4.观察病情变化：密切观察小儿的体温、精神状态、呼吸等情况，如有异常及时就医。