三个月婴儿鼻塞，可能由环境刺激、呼吸道感染等引起。可采取以下方法处理：
1.清理鼻腔：使用生理性海盐水滴鼻或喷鼻，软化、稀释鼻腔分泌物，然后使用吸鼻器吸出分泌物，以缓解鼻塞。但操作时应轻柔，避免损伤婴儿鼻粘膜。
2.改变体位：有时鼻塞是由于分泌物在鼻腔内积聚引起的。尝试改变婴儿的体位，如侧卧或俯卧，有时可以改善鼻塞。
3.保持适宜的环境：保持室内空气湿润，使用加湿器可以缓解婴儿的鼻塞。同时，避免在婴儿的房间内吸烟或有强烈的异味。
4.热敷：用温热的湿毛巾轻轻敷在婴儿的鼻子上，有助于减轻鼻塞。但要注意温度不要过高，以免烫伤婴儿。
5.按摩鼻部：用手指轻轻按摩婴儿的鼻子两侧，促进鼻部血液循环，缓解鼻塞。
6.就医：如果婴儿鼻塞严重，影响呼吸、吃奶或睡眠，或者伴有发热、咳嗽等症状，应及时就医。医生可能会根据具体情况给予适当的治疗，如使用药物滴鼻、口服药物等。
需要注意的是，对于三个月的婴儿，任何治疗方法都应在医生的指导下进行，以确保安全有效。同时，要密切观察婴儿的情况，如果症状持续不缓解或加重，应及时复诊。