半夜发烧39℃是一种常见的症状，需要采取适当的措施来降低体温，以下是一些建议：
1.测量体温：使用体温计测量体温，确保准确读数。如果体温确实为39℃，属于高烧，需要及时处理。
2.补充水分：发烧会导致身体水分流失，应多喝水或饮用适量的电解质饮料，以保持身体水分平衡。
3.松解衣物：确保穿着舒适宽松的衣物，避免过多过厚的衣物影响散热。
4.物理降温：可以采用温水擦拭身体、使用冰袋等方法来降低体温。但需注意，对于3个月以下的婴儿，发烧时不宜采用酒精擦浴的方法。
5.药物治疗：可以使用退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬，但需按照药品说明书的剂量和使用方法服用。在使用退烧药之前，最好咨询医生的建议。
6.就医咨询：如果发烧持续时间较长、体温较高、伴有其他不适症状，或有基础疾病的人群，应及时就医。医生会根据具体情况进行诊断，并给予相应的治疗建议。
需要注意的是，对于儿童、孕妇、老年人或患有基础疾病的人群，发烧可能会带来更大的风险，应特别关注。如果对发烧的处理有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的意见。同时，定期测量体温，密切观察身体状况的变化，如果症状加重或出现其他异常，应及时就医。