舌头根部长了凸起肉粒疼，可能是以下原因引起：
1.轮廓乳头炎：轮廓乳头位于舌根部，呈人字排列，炎症时可出现舌根部凸起肉粒、疼痛。乳头炎多由厌氧菌感染引起，可使用甲硝唑、替硝唑等药物治疗。
2.舌根淋巴滤泡增生：舌根的淋巴滤泡可因咽部炎症、扁桃体炎等刺激而增生，表现为舌根部凸起肉粒、咽痛等。可使用蒲地兰消炎口服液、蓝芩口服液等药物治疗。
3.舌根肿瘤：舌根部肿瘤也可表现为凸起肉粒，伴有疼痛、出血、吞咽困难等症状。需及时就医，行病理活检以明确诊断，根据肿瘤的性质、大小等决定治疗方法。
4.其他：舌根部的良性肿瘤、乳头状瘤、舌扁桃体肥大等也可出现类似症状。
此外，长期吸烟、饮酒、过度用嗓等也可能导致舌根部黏膜损伤，出现疼痛、凸起等症状。
总之，舌头根部长了凸起肉粒疼的原因较多，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，应注意保持口腔卫生，避免食用辛辣、刺激性食物，戒烟戒酒，减少对舌头的刺激。