一、生理性因素
（一）凝血因子合成不足
新生儿出生时，其肝脏合成凝血因子的功能尚未完全成熟，例如维生素K依赖的凝血因子Ⅱ、Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ等在新生儿体内水平相对较低。这是因为胎儿时期通过胎盘获得的维生素K量有限，而新生儿出生后肠道合成维生素K的能力也较弱，导致凝血因子合成不足，使得凝血功能相对较差。
（二）血小板数量及功能特点
新生儿血小板数量在出生时基本接近成人水平，但血小板的功能存在一定不足。例如血小板的黏附、聚集等功能相对较弱，这也会影响凝血过程，使得新生儿凝血功能处于相对较差的状态。
二、病理性因素
（一）感染因素
当新生儿发生感染时，如败血症等，病原体及其毒素会影响凝血系统。一方面，感染可导致血管内皮损伤，激活凝血途径；另一方面，感染会使机体的凝血调节功能紊乱，例如炎症因子可影响凝血因子的活性和血小板的功能，从而引起凝血功能差。例如有研究表明，败血症患儿体内多种凝血相关指标会出现异常，如凝血酶原时间延长等。
（二）先天性出血性疾病
1.血友病：这是一组遗传性凝血因子缺乏引起的出血性疾病。例如血友病A是由于凝血因子Ⅷ缺乏所致，血友病B是由于凝血因子Ⅸ缺乏所致。新生儿期发病时可表现为凝血功能差，出现出血倾向，如皮肤瘀斑、黏膜出血等。其发病机制是遗传因素导致相应凝血因子基因缺陷，使得凝血因子合成障碍或功能异常。
2.先天性纤维蛋白原缺乏症：这是一种罕见的遗传性疾病，由于编码纤维蛋白原的基因缺陷，导致新生儿体内纤维蛋白原合成减少或功能异常，从而影响凝血过程，出现凝血功能差及相应的出血表现。
（三）其他疾病
1.新生儿窒息：新生儿窒息时，机体处于缺氧、酸中毒状态，可导致血管内皮损伤，激活凝血系统，同时组织缺氧也会影响凝血因子的合成和功能，进而引起凝血功能差。例如有研究发现，新生儿窒息后凝血酶原时间、部分凝血活酶时间等凝血指标会发生改变。
2.新生儿溶血病：当新生儿发生溶血病时，红细胞破坏增多，释放出大量的红细胞内容物，如红细胞膜上的磷脂等物质，可激活凝血途径，导致凝血功能异常。同时，溶血过程中产生的一些物质也会影响凝血因子和血小板的功能，使得新生儿凝血功能差，出现皮肤黄疸、出血等一系列表现。
三、医源性因素
（一）操作过程中的影响
在新生儿的一些医疗操作中，如频繁采血、中心静脉置管等，可能会对新生儿的血管内皮造成损伤，从而激活凝血系统，导致短暂的凝血功能改变。例如多次采血后，可能会因为血小板丢失等原因，影响凝血功能。
（二）药物使用相关
某些药物的使用可能会影响新生儿的凝血功能。例如一些抗生素的使用可能会引起新生儿体内维生素K缺乏相关的凝血功能异常，因为某些抗生素可抑制肠道细菌合成维生素K，而维生素K是参与凝血因子合成的重要物质。