23价肺炎疫苗可覆盖23种常见肺炎球菌血清型，适用于2岁以上高危人群及成人，接种1次；13价肺炎疫苗覆盖13种血清型，主要用于6周龄 - 5岁儿童，需接种多剂次。
疫苗覆盖血清型差异
23价肺炎疫苗涵盖23种肺炎球菌血清型，涵盖范围广但针对儿童等特定人群保护相对有限；13价肺炎疫苗包含13种常见且致病力强的血清型，对儿童常见致病血清型针对性强。
适用人群不同
23价肺炎疫苗适用于2岁以上患有慢性疾病（如心脏病、肺病、糖尿病等）、免疫功能低下者及65岁以上老年人；13价肺炎疫苗主要针对6周龄 - 5岁婴幼儿、未接种过该疫苗的2 - 5岁儿童。
接种程序有别
23价肺炎疫苗通常只需接种1剂，若为免疫功能低下者，5年后可再接种1剂；13价肺炎疫苗对于6周龄 - 18月龄婴幼儿，一般需接种2 - 3剂，12 - 23月龄幼儿接种2剂，2 - 5岁儿童接种1剂。
免疫应答特点差异
23价肺炎疫苗对2岁以下儿童免疫应答较差；13价肺炎疫苗在婴幼儿中能诱导产生较好的免疫应答，引发的抗体反应更持久有力。