23价肺炎疫苗涵盖23种肺炎球菌血清型，可预防多种肺炎球菌感染，适用于2岁以上高危人群及免疫功能低下者，接种1次；13价肺炎疫苗覆盖13种常见肺炎球菌血清型，主要针对2岁以下婴幼儿等，需接种多剂次。
疫苗覆盖血清型差异
23价肺炎疫苗包含23种肺炎球菌血清型，能预防由这23种血清型引起的肺炎球菌性疾病；13价肺炎疫苗包含13种血清型，相对覆盖血清型较少，但针对的是儿童易感染的主要血清型。
适用人群不同
23价肺炎疫苗适用于2岁以上患有慢性疾病（如心脏病、肺病、糖尿病等）、免疫功能低下、老年人等高危人群；13价肺炎疫苗主要适用于6周龄 - 5岁婴幼儿、未接种过本疫苗的2 - 5岁儿童。
接种程序有别
23价肺炎疫苗通常只需接种1剂，若为免疫功能低下者，5年后可再接种1剂；13价肺炎疫苗接种程序为基础免疫在2、4、6月龄各接种1剂，加强免疫在12 - 15月龄接种1剂，全程需接种4剂。
免疫持续时间差异
23价肺炎疫苗接种后，抗体持续时间约5年；13价肺炎疫苗接种后，抗体持续时间相对较长，且对婴幼儿的保护更为持久。
对于婴幼儿等特殊人群，接种肺炎疫苗前需确保身体状况良好，若有发热、急性感染等情况应暂缓接种。老年人接种时要考虑自身基础疾病情况，在健康状态下接种能更好发挥疫苗保护作用。