23价肺炎疫苗覆盖23种肺炎球菌血清型，用于2岁以上肺炎球菌疾病高危人群及成人，免疫持续时间约5年；13价肺炎疫苗覆盖13种血清型，主要用于6周龄 - 5岁婴幼儿和儿童，免疫原性好，诱导产生抗体反应更强。
一、接种人群不同
23价肺炎疫苗适用于2岁以上肺炎球菌疾病高危人群（如慢性疾病患者、老年人等）以及成人；13价肺炎疫苗主要针对6周龄 - 5岁婴幼儿和儿童。因为婴幼儿和儿童免疫系统尚不完善，易受肺炎球菌侵袭，13价疫苗对其保护更关键。
二、覆盖血清型有别
23价肺炎疫苗涵盖23种肺炎球菌血清型；13价肺炎疫苗包含13种血清型。13价覆盖的血清型中，部分是引起儿童严重侵袭性疾病的主要血清型，能更有针对性保护儿童。
三、免疫持续时间差异
23价肺炎疫苗免疫持续时间约5年；13价肺炎疫苗免疫持续时间相对较短，但由于其针对婴幼儿等特殊人群，接种程序设计能更好激发免疫记忆。对于婴幼儿，按程序接种可在关键易感期提供持续保护。
四、接种程序不同
23价肺炎疫苗通常只需接种1剂；13价肺炎疫苗接种程序相对复杂，6周龄 - 6月龄婴儿需接种4剂，7 - 11月龄婴儿接种3剂，12 - 23月龄幼儿接种2剂，2 - 5岁儿童接种1剂。不同接种程序是根据不同年龄段免疫系统发育特点制定，以达到最佳免疫效果。