13价肺炎疫苗与23价肺炎疫苗主要有接种对象、覆盖血清型等方面的区别。13价肺炎疫苗主要针对2岁以下婴幼儿等特定人群，覆盖13种肺炎球菌血清型；23价肺炎疫苗适用于2岁以上特定高危人群等，覆盖23种肺炎球菌血清型。
接种对象差异
13价肺炎疫苗主要用于6周龄 - 5岁婴幼儿和儿童，因为这个年龄段孩子免疫系统相对不完善，接种13价肺炎疫苗可针对性预防相关血清型肺炎球菌感染。而23价肺炎疫苗适合2岁以上患有慢性疾病（如心脏病、肺病、糖尿病等）、免疫功能低下者以及65岁以上老年人等，这些人群接种23价肺炎疫苗来预防相应肺炎球菌感染。
覆盖血清型不同
13价肺炎疫苗涵盖了13种常见的肺炎球菌血清型，能对婴幼儿常见且致病力较强的血清型起到较好防护作用。23价肺炎疫苗覆盖23种肺炎球菌血清型，覆盖范围更广，但对于2岁以下婴幼儿的针对性不如13价肺炎疫苗。
免疫持续时间有别
13价肺炎疫苗在婴幼儿体内产生的免疫持续时间相对23价肺炎疫苗对于一些人群有差异，13价肺炎疫苗对于婴幼儿的基础免疫构建很关键，而23价肺炎疫苗对于特定成人高危人群的免疫保护持续时间需根据个体情况等综合考量。
接种程序不同
13价肺炎疫苗接种程序一般是基础免疫在2、4、6月龄各接种一剂，加强免疫在12 - 15月龄接种一剂。23价肺炎疫苗通常是只需接种一剂，但若有需要后续可能根据情况再评估是否需再次接种等。
对于婴幼儿接种13价肺炎疫苗，要在孩子健康状态下进行接种，接种后需在接种点观察一段时间，看是否有不良反应等。对于老年人等接种23价肺炎疫苗，要告知医生自身基础疾病情况，以便医生评估接种风险等。