先天性胆管扩张症引起肝功能异常的原因主要与胆道梗阻、胆汁淤积、胆管炎等因素有关，具体如下：
1.胆道梗阻：先天性胆管扩张症可导致胆管部分或完全阻塞，胆汁排泄受阻，进而引起胆汁淤积。胆汁中的胆红素和其他有害物质无法正常排出体外，会反流进入血液循环，导致肝细胞损伤和肝功能异常。
2.胆汁淤积：胆汁淤积会使胆汁酸在肝脏内潴留，进而损害肝细胞，导致肝细胞变性、坏死和肝功能异常。
3.胆管炎：先天性胆管扩张症容易并发胆管炎，胆管炎症可进一步加重胆道梗阻和胆汁淤积，从而损伤肝功能。
4.其他因素：长期的胆道梗阻和胆汁淤积还可能导致肝硬化、肝纤维化等并发症，进一步损害肝功能。
针对先天性胆管扩张症引起的肝功能异常，治疗方法主要包括以下几个方面：
1.利胆治疗：使用利胆药物促进胆汁排泄，减轻胆汁淤积对肝脏的损害。
2.病因治疗：积极治疗先天性胆管扩张症，解除胆道梗阻，如手术治疗等。
3.保肝治疗：使用保肝药物，如护肝片、复方甘草酸苷等，保护肝细胞，促进肝功能恢复。
4.并发症治疗：针对肝硬化、肝纤维化等并发症进行相应的治疗。
5.饮食调整：给予低脂、高维生素的饮食，避免食用油腻、刺激性食物，以减轻肝脏负担。
需要注意的是，先天性胆管扩张症引起的肝功能异常应在医生的指导下进行综合治疗。同时，定期复查肝功能、腹部超声等检查，以便及时调整治疗方案。