食管反流通常是多种因素共同作用导致的。比如下食管括约肌功能障碍是常见原因之一，正常情况下下食管括约肌能防止胃内容物反流至食管，当它压力降低时，就容易引发食管反流。据统计，约有40% - 60%的食管反流患者存在下食管括约肌压力降低的情况。
解剖结构相关因素
食管下括约肌结构异常： 食管下括约肌是食管末端的环形肌，若其结构出现问题，比如肌肉发育不良等，就会影响其正常功能，导致食管反流发生。例如先天性食管下括约肌结构异常的人群，相对更容易出现食管反流现象。食管清除作用降低： 食管对反流物的清除主要依靠食管蠕动和唾液的中和作用。当食管蠕动减弱时，比如老年人食管蠕动功能减退，就会使反流物在食管内停留时间延长，增加食管反流的风险。同时，唾液分泌减少也会影响对反流物的中和，进而加重食管反流情况。
胃部相关因素
胃排空延迟： 胃排空速度减慢时，胃内食物潴留，胃内压力升高，就容易导致胃内容物反流至食管。一般来说，当胃排空时间超过正常范围（正常胃排空时间约为2 - 4小时），就可能引发食管反流相关症状。比如患有糖尿病的患者，由于自主神经病变等原因，常出现胃排空延迟，从而增加食管反流的发生率。胃内压增高： 一些情况会导致胃内压升高，像暴饮暴食后，胃内食物过多，胃内压力急剧上升，超过食管下括约肌压力时，就容易引起反流。另外，患有幽门梗阻的患者，胃内容物排出受阻，胃内压力持续增高，也极易发生食管反流。
生活方式相关因素
饮食因素： 过多食用高脂肪、巧克力、咖啡等食物，会降低食管下括约肌压力，从而诱发食管反流。比如一次性大量摄入高脂肪食物后，约30分钟 - 1小时就可能出现食管反流症状。还有，饮用咖啡后15 - 30分钟，就可能刺激胃酸分泌增加，导致食管反流。肥胖因素： 肥胖人群腹腔内压力增高，容易压迫胃部，使胃内压力升高，进而促使胃内容物反流至食管。研究表明，体重指数（BMI）超过28的肥胖者，食管反流的发生率比正常体重者高出约50%。吸烟与饮酒： 吸烟会削弱食管下括约肌的功能，还会减少唾液分泌，影响食管的清除作用。长期饮酒会刺激胃酸分泌，损伤食管黏膜，增加食管反流的发生几率。例如，每天吸烟超过20支的人，食管反流的风险比不吸烟者高3倍左右；长期大量饮酒者，食管反流的患病率明显高于不饮酒者。