慢性肠胃炎常见的症状表现多样，患者常出现反复的腹部不适，一般病程会持续数月甚至更久。
消化道症状表现
腹痛：多数患者会有腹部隐痛的情况，疼痛位置不固定，有的在肚脐周围，有的在上腹部，疼痛程度轻重不一，可能是轻微的胀痛，也可能是隐隐的刺痛，一般进食后可能会有一定程度的加重，但休息后可能会有所缓解。腹泻：大便次数会增多，每天可能会排便3~5次甚至更多，大便性状也会改变，可为稀便、糊状便等，有的患者可能还会伴有黏液便，不过一般黏液量不多。
全身症状表现
乏力：由于胃肠道长期不适，影响营养的吸收，患者会感觉身体没有力气，容易疲劳，活动耐力下降，比如原本能走较长的路，患病后走一小段路就会觉得累。消瘦：如果病情持续时间较长，营养吸收不良，体重会逐渐下降，一般在几个月内可能会减轻3~5公斤甚至更多，尤其是一些病程较长的慢性肠胃炎患者，消瘦情况会比较明显。
其他伴随症状表现
食欲减退：患者对食物的兴趣降低，吃饭时没有胃口，食量明显减少，可能原本一顿能吃一碗饭，现在只能吃半碗甚至更少，长期如此会影响身体的营养状况。恶心呕吐：部分患者会出现恶心的感觉，严重时可能会伴有呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般呕吐的频率不是很高，可能几天出现一次。另外，有些患者还可能会有反酸、嗳气等症状，比如经常感觉胸口有灼热感，或者时不时会打出气来。