慢性胃肠炎的症状表现多样，常见的有腹痛，多数患者会出现程度不同的腹痛，疼痛部位多在肚脐周围或上腹部，疼痛性质可为隐痛、胀痛等，一般持续时间可能在数分钟到数小时不等。
胃肠道相关症状表现
腹痛： 慢性胃肠炎患者的腹痛没有固定的发作时间，可能在进食后发作，也可能在空腹时出现。部分患者还可能伴有腹胀，感觉腹部胀满不适，尤其是进食后腹胀感更明显。腹泻： 多数患者会有腹泻症状，大便次数增多，一般每天可能会有3 - 5次，甚至更多。大便性状可呈稀水样、糊状等，有的患者腹泻与便秘会交替出现。
全身相关症状表现
乏力： 由于胃肠功能紊乱，营养吸收受到影响，患者可能会感到全身乏力，精神状态欠佳，日常活动容易疲惫。消瘦： 长期的慢性胃肠炎会影响营养物质的消化吸收，时间久了可能导致患者体重下降、消瘦，如果病情持续不改善，体重可能会持续减轻。
其他伴随症状表现
恶心呕吐： 部分慢性胃肠炎患者会出现恶心症状，严重时可能会伴有呕吐，呕吐物多为胃内容物，有的患者呕吐后症状可能会有所缓解，但容易反复发作。食欲减退： 患者往往食欲不佳，对食物的兴趣降低，进食量减少，这也会进一步影响营养的摄入，加重身体的不适。