大姨妈痛经的原因有多种。其中，原发性痛经比较常见，多见于青春期女性，主要与月经时子宫内膜前列腺素含量增高有关，前列腺素F2α和前列环素增加，可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现痛经，这种情况在初潮后1~2年内发生较多。
子宫内膜异位症导致
异位内膜种植： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时，就可能引发痛经。比如异位到卵巢形成卵巢巧克力囊肿，在月经期间，异位的内膜也会出血，刺激周围组织，导致痛经，而且这种痛经往往会进行性加重。盆腔粘连影响： 子宫内膜异位症还可能引起盆腔粘连，影响盆腔内的血液循环等，使得月经时疼痛加剧，有些患者还可能伴有性交痛、不孕等问题。
子宫腺肌病引起
子宫肌层病变： 主要是子宫肌层内的异位内膜腺体充血、周期性出血，导致子宫增大、子宫肌层纤维收缩，从而引起痛经。这种痛经多在经前一周开始出现，月经来潮时达到高峰，且会持续整个经期。患者往往还会有月经量增多、经期延长等表现。
盆腔炎症相关
炎症刺激： 盆腔存在炎症时，月经期间盆腔充血会加重炎症反应，刺激周围组织，引发痛经。这类患者通常还会有下腹部坠胀、疼痛，以及白带增多、月经紊乱等症状，而且炎症如果不及时控制，可能会反复发作，影响生活质量。