大姨妈痛经的原因有多种。其中，原发性痛经比较常见，约占痛经的90%以上，主要与月经时子宫内膜前列腺素含量增高有关，前列腺素F2α和前列腺素E2含量升高，可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现痛经，通常在月经初潮后1 - 2年内出现。
子宫内膜异位症导致的痛经
异位内膜种植： 具有活性的子宫内膜细胞种植在子宫以外的部位，如卵巢、盆腔腹膜等，这些异位的内膜会随月经周期发生周期性出血，刺激周围组织，引起疼痛。一般在月经前1 - 2天开始出现痛经，经期第1天最严重，以后逐渐减轻，但呈进行性加重。盆腔粘连： 异位的内膜组织反复出血会导致盆腔内器官与组织发生粘连，影响盆腔的正常生理结构和功能，也会加重痛经症状。
子宫腺肌病引发的痛经
子宫肌层病变： 主要是子宫内膜腺体和间质侵入子宫肌层，导致子宫均匀性增大，肌层内的异位内膜病灶在月经周期中充血、水肿，刺激子宫肌层收缩，从而引起痛经。这种痛经多在经前一周开始出现，月经来潮时达高峰，且进行性加重。子宫体积变化： 由于子宫腺肌病患者子宫体积增大，子宫肌层张力增加，也会加重痛经感觉。
盆腔炎性疾病相关痛经
炎症刺激： 盆腔内存在炎症时，如盆腔炎，炎症会导致盆腔组织充血、水肿，在月经期间，盆腔充血状态加重，炎症对周围组织的刺激也会加剧，从而引发痛经。一般表现为下腹部持续性疼痛，在月经期间疼痛会加重，还可能伴有白带增多、发热等症状。组织粘连： 盆腔炎性疾病如果没有得到及时有效的治疗，可能会引起盆腔组织粘连，影响盆腔内器官的正常功能，进而加重痛经。