耳膜内陷可以通过多种方式来治疗，一般可通过改善咽鼓管功能等方法来处理。比如，对于因感冒等引起的轻度耳膜内陷，可先观察一段时间，部分人能自行恢复。
咽鼓管吹张法
捏鼻鼓气法： 闭上嘴巴，捏住鼻子，然后用力呼气，让气流经咽鼓管进入中耳，每次做3 - 5次，每天可做几次。但要注意，感冒鼻塞严重时不宜用这个方法。导管吹张法： 需由医生操作，医生会将咽鼓管导管插入鼻腔后端，然后轻轻吹气，使气体进入中耳。这种方法一般在医院由专业医生进行，能更精准地改善咽鼓管通气情况。
治疗原发病
鼻炎、鼻窦炎引起的耳膜内陷： 如果是鼻炎、鼻窦炎导致的咽鼓管功能障碍进而引起耳膜内陷，需要积极治疗鼻炎、鼻窦炎。比如，过敏性鼻炎患者要避免接触过敏原，可使用抗过敏药物，像氯雷他定等（仅说明药物名称及对应情况，不涉及剂量等服用指导）来控制症状，减少鼻腔分泌物对咽鼓管的影响。腺样体肥大引起的耳膜内陷： 儿童如果有腺样体肥大，也可能引发耳膜内陷。对于腺样体肥大明显的儿童，可能需要考虑手术切除腺样体，以恢复咽鼓管的正常通气功能。
鼓膜按摩
自行按摩： 可以用手指轻轻按压耳屏，然后快速松开，这样能使鼓膜内外气压得到调节。每天可进行几次，每次按压松开10 - 15下左右。不过要注意力度适中，不要过于用力损伤耳朵。医生辅助按摩： 医生也可以通过专业的设备或手法来对鼓膜进行按摩，能更有效地改善耳膜内陷的情况，这种方法一般在医院的耳鼻喉科由医生操作。