结肠癌的发病原因较为复杂，目前认为多种因素综合作用可引发该病。据相关研究，大约10% - 15%的结肠癌与遗传因素密切相关，比如家族性腺瘤性息肉病等遗传性疾病会显著增加患结肠癌的风险。
遗传因素相关
家族遗传综合征： 像林奇综合征，这是一种常染色体显性遗传病，由DNA错配修复基因发生突变引起，携带相关突变基因的人群，患结肠癌的概率比正常人高出很多倍。基因突变遗传： 如果家族中有直系亲属患有结肠癌，其后代携带相关致癌基因突变的几率会增加，从而使患结肠癌的风险上升。
饮食因素影响
高脂肪低纤维饮食： 长期摄入高脂肪的食物，比如油炸食品、肥肉等，会使肠道内胆汁酸分泌增多，胆汁酸在肠道细菌作用下可转化为致癌物质。而低纤维饮食会导致肠道蠕动减慢，粪便在肠道内停留时间延长，有害物质与肠道黏膜接触时间增加，容易诱发结肠癌。腌制烟熏食物： 腌制食品中含有较多亚硝酸盐，烟熏食物在制作过程中会产生苯并芘等致癌物质，长期大量食用这类食物，会增加结肠癌的发病风险。
肠道疾病影响
结肠息肉： 结肠息肉尤其是腺瘤性息肉，如果不及时治疗，长时间后有可能发生癌变。一般来说，直径大于2厘米的腺瘤性息肉癌变几率明显增高。炎症性肠病： 如溃疡性结肠炎，患者肠道长期处于炎症状态，炎症反复刺激肠道黏膜，会使肠道黏膜不断修复再生，在此过程中容易发生基因突变，进而引发结肠癌，这类患者患结肠癌的风险比正常人高5 - 10倍。