病毒性软疣主要通过局部治疗来改善，一般采用物理治疗或外用药物等方式。比如液氮冷冻治疗，通常1 - 2次可能见效。
物理治疗方法
液氮冷冻： 利用低温使软疣小体坏死脱落。医生会用棉签蘸取液氮，涂抹在软疣患处，一般每周可进行1次，多数患者经过2 - 3次治疗能去除软疣。操作时要注意避免冻伤周围正常皮肤。刮除术： 用消毒后的刮匙将软疣小体刮除。医生会先对局部进行消毒，然后用刮匙把软疣的核心部分刮出，之后可能会涂抹碘伏等进行消毒处理。操作后要保持局部清洁，防止感染。
外用药物治疗
维A酸软膏： 维A酸可以调节上皮细胞的生长和分化，对软疣有一定的治疗作用。每天外用1 - 2次，连续使用几周可能看到效果。但使用时要注意避免接触眼睛和口腔等黏膜部位，且孕妇禁用。斑蝥素： 斑蝥素能引起表皮坏死脱落，从而达到治疗软疣的目的。不过使用斑蝥素时要注意准确涂抹在软疣部位，避免接触正常皮肤，且儿童要谨慎使用，因为其可能对皮肤有较强刺激性。
日常注意事项
避免搔抓： 病毒性软疣患者要尽量避免用手搔抓患处，防止自身接种感染，导致软疣数量增多。比如不要用手去抠挠长软疣的地方，以免其他部位也感染上软疣。注意个人卫生： 要保持皮肤清洁，勤换洗衣物。贴身衣物最好用开水烫洗，然后在阳光下暴晒，以杀灭可能存在的病毒。例如每周至少更换1 - 2次内衣裤，并且定期对毛巾、浴巾等个人物品进行消毒处理。增强免疫力： 平时要注意合理饮食，保证营养均衡，多吃蔬菜水果，摄入足够的维生素和矿物质。同时要适当运动，比如每天进行30分钟左右的有氧运动，像散步、慢跑等，以增强身体免疫力，有助于身体对抗病毒，促进软疣的恢复。