三个月的宝宝晚上睡觉不踏实、老是翻来覆去，可能有以下原因：
一、维生素D缺乏：常见于未补充或补充不足维生素D的宝宝。这种情况下，宝宝除了夜间睡眠不安稳易醒，还会有夜间哭闹、多汗、摇头、枕秃等表现。此时通过给宝宝补充维生素D、多晒太阳以及适当进行户外活动等措施，可逐渐缓解症状。
1.补充维生素D：这是改善此情况的重要手段。
2.多晒太阳：有助于促进维生素D的合成。
3.适当户外活动：对宝宝的健康有益。
二、胃肠功能紊乱：如果宝宝有受凉的情况，或者平时胃肠功能就一般，存在平时大便次数增多、大便性状改变等肠道症状，那么宝宝可能因为胃肠道不适而在睡觉时总是醒来。
1.受凉因素：可能引发胃肠功能紊乱。
2.本身胃肠功能欠佳：容易出现相关症状。
三、惊吓：部分宝宝受到惊吓后，容易出现夜间异常哭闹，经安抚后可缓解。
总的来说，三个月宝宝出现晚上睡觉不踏实、老是翻来覆去的情况原因较多。可以先按照各类原因进行分析，或尝试各种方法看怎样能让其最快重新入睡。如果仍无改善，必要时需到医院就诊。
总结：对于三个月宝宝睡觉不踏实的情况，要仔细分析可能的原因，采取相应措施，必要时寻求专业帮助。