三个月婴儿睡觉老是摇头，可能是以下原因：
1.正常的生理现象：三个月的婴儿神经系统发育还不完善，容易受到外界环境的影响，导致睡眠不安稳，出现摇头的情况。这种情况一般不需要特殊处理，随着婴儿的生长发育，会逐渐消失。
2.湿疹：如果婴儿头部有湿疹，会因为瘙痒而导致摇头。湿疹会使婴儿的头部出现红斑、丘疹、水疱等，伴有瘙痒感。家长可以观察婴儿的头部是否有湿疹，如果有，可以在医生的指导下给婴儿使用湿疹膏。
3.缺钙：婴儿缺钙会导致神经兴奋性增加，出现多汗、烦躁、摇头等症状。家长可以带婴儿到医院检查微量元素，如果缺钙，可以在医生的指导下给婴儿补充钙剂和维生素D。
4.中耳炎：如果婴儿患有中耳炎，会因为耳部疼痛而出现摇头。中耳炎会导致婴儿耳部疼痛、听力下降、发热等症状。家长可以观察婴儿的耳部是否有分泌物，如果有，需要及时带婴儿到医院就诊。
5.其他：如果婴儿患有其他疾病，如感冒、肺炎等，也会因为身体不适而出现摇头的情况。家长需要密切观察婴儿的情况，如果有其他异常，需要及时带婴儿到医院就诊。
总之，如果家长发现三个月的婴儿睡觉老是摇头，需要密切观察婴儿的情况，如果伴有其他异常症状，需要及时带婴儿到医院就诊，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。