肛周脓肿主要是由肛腺感染引起的，约90%的肛周脓肿与肛腺感染相关。肛腺开口于直肠肛瓣处，当粪便等异物堵塞肛窦，就容易引发肛腺感染，感染蔓延可形成肛周脓肿。
肛腺感染引发的具体情况
肛窦损伤引发： 粪便干结等原因容易损伤肛窦，使得细菌容易侵入肛腺。据统计，约有超过80%的肛周脓肿起始于肛窦的感染。细菌在肛腺内繁殖，炎症逐渐扩散，向周围组织蔓延，就可能形成肛周脓肿。肛腺阻塞导致： 肛腺分泌的液体起到润滑肠道的作用，但如果肛腺导管发生阻塞，分泌物无法正常排出，就会在腺体内积聚，为细菌的滋生提供了良好的环境，进而引发感染，最终形成肛周脓肿。
身体抵抗力因素影响
免疫力低下人群： 比如患有糖尿病的患者，由于血糖控制不佳，身体的抵抗力相对较弱，白细胞的杀菌能力受到影响，更容易受到细菌的侵袭。研究表明，糖尿病患者发生肛周脓肿的概率比正常人高2~3倍。另外，长期使用免疫抑制剂的人，如器官移植后需要服用免疫抑制剂来防止排斥反应的患者，其身体免疫力被抑制，也容易患上肛周脓肿。婴幼儿群体： 婴幼儿的免疫系统尚未完全发育成熟，抵抗力相对较差。而且婴幼儿肛门周围的皮肤比较娇嫩，容易受到损伤，一旦有细菌入侵，就较容易引发肛腺感染，从而导致肛周脓肿的发生。
局部卫生不良的影响
不注意清洁： 部分人群不注重肛门局部的清洁卫生，如排便后没有及时清洁肛门周围，粪便残留容易滋生细菌。长时间如此，细菌就可能通过肛窦侵入肛腺，引发感染形成肛周脓肿。特别是一些老年人行动不便，或者儿童卫生习惯较差，更容易出现这种情况。穿着不恰当： 穿着紧身、不透气的内裤，会使肛门周围的局部环境潮湿、不通风，有利于细菌的生长繁殖。比如长期穿着化纤材质的紧身内裤，肛门周围的温度和湿度适宜细菌滋生，增加了肛周脓肿的发病风险。