来月经时小肚子疼和腰疼，可能是以下原因引起：
1.生理原因：
前列腺素分泌增加：来月经时，子宫内膜会分泌前列腺素。前列腺素含量升高可能会引起子宫平滑肌过强收缩、血管挛缩，造成子宫缺血、乏氧状态，从而出现痛经。同时，前列腺素也可能会刺激胃肠道，引起胃肠道平滑肌收缩，出现恶心、呕吐等胃肠道症状。此外，前列腺素还可能会引起腰部血管收缩，导致腰部疼痛。
盆腔充血：月经期间，盆腔会充血，可能会压迫腰部的神经，导致腰部疼痛。
2.病理原因：
子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织（腺体和间质）在子宫腔被覆内膜及子宫以外的部位出现、生长、浸润，反复周期性出血，继而引发疼痛、不孕及结节或包块等。子宫内膜异位症可能会导致痛经、性交痛、慢性盆腔痛、月经异常等症状，其中痛经是子宫内膜异位症最典型的症状。
盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症。盆腔炎可能会导致下腹疼痛、腰骶部疼痛、性交痛等症状，在月经期可能会加重。
子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，是女性最常见的良性肿瘤。子宫肌瘤可能会导致月经异常、腹部肿块、白带增多、腹痛、腰酸、下腹坠胀等症状。
其他：子宫内膜息肉、子宫腺肌病、宫颈炎等疾病也可能会导致月经时小肚子疼和腰疼。
如果来月经时小肚子疼和腰疼的症状比较轻微，可以通过以下方法缓解：
1.注意保暖：可以使用热水袋或热毛巾敷在腹部或腰部，以缓解疼痛。
2.注意休息：避免过度劳累，保证充足的睡眠。
3.调整饮食：避免食用辛辣、生冷、刺激性食物，多吃一些温热、易消化的食物。
4.心理调节：保持心情愉悦，避免紧张、焦虑等不良情绪。
如果来月经时小肚子疼和腰疼的症状比较严重，或者通过以上方法无法缓解，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。