矮小症主要由多种原因造成。据统计，约30%的矮小症与生长激素缺乏有关。
一、遗传因素导致
基因缺陷： 某些基因的突变或缺陷可能直接影响孩子的生长发育。比如，特纳综合征就是由于性染色体异常导致的，常见于女性儿童，会出现身材矮小的典型症状。家族遗传倾向： 如果家族中有矮小的遗传史，孩子患矮小症的概率相对会增高。比如父母双方身材较矮，孩子遗传到相关基因后，生长可能受到影响。
二、内分泌疾病引发
生长激素缺乏症： 垂体分泌生长激素不足是常见原因之一。垂体是调节生长激素分泌的重要内分泌器官，若垂体功能出现问题，生长激素分泌量就会减少，从而影响骨骼的生长和身体的发育，导致身材矮小。甲状腺功能减退： 甲状腺分泌的甲状腺激素对生长发育也至关重要。当甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会使孩子的生长速度减慢，出现身材矮小、智力发育可能也受影响等情况。
三、慢性疾病影响
营养不良： 长期的营养不良会阻碍孩子的生长。比如饮食中蛋白质、热量、维生素及矿物质等摄入不足，会影响骨骼的生长和身体各器官的发育。像一些贫困地区或喂养不当的婴幼儿，就容易因营养不良出现矮小的状况。慢性肾病： 患有慢性肾病的孩子，由于肾脏功能受损，会影响体内激素的代谢和营养物质的吸收等，进而影响生长发育，导致身材较同龄人矮小。
四、其他因素干扰
宫内发育迟缓： 胎儿在宫内生长受限，出生时体重和身高就低于正常标准，出生后继续生长可能也会比正常孩子慢，从而容易出现矮小的情况。比如母亲在孕期有吸烟、酗酒等不良行为，或患有某些疾病影响胎盘供血等，都可能导致胎儿宫内发育迟缓。心理因素： 长期处于精神压抑、紧张的环境中，也可能影响孩子的生长激素分泌，进而影响身高。比如家庭关系不和睦、学习压力过大等情况，可能会对孩子的生长发育产生负面作用。