心肌炎通常是由病毒感染、自身免疫性疾病、药物或毒物等因素引起。其中病毒感染是最常见的原因，比如柯萨奇B组病毒，约占病毒性心肌炎病因的30%~50%。
病毒感染引发
肠道病毒感染： 像柯萨奇病毒、埃可病毒等肠道病毒，很容易侵袭人体，然后进入心肌细胞，在里面大量繁殖，从而直接损伤心肌细胞，引发炎症反应。一般在病毒感染后的1~3周内，就比较容易出现心肌炎症状。呼吸道病毒感染： 流感病毒、腺病毒等呼吸道病毒也是常见诱因。当人体感染这类病毒后，病毒会通过血液循环到达心脏，对心肌组织造成侵害，引发心肌炎。
自身免疫性疾病导致
结缔组织病相关： 像系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等结缔组织病，患者自身免疫系统会错误地攻击自身的心肌组织，从而引发心肌炎。这类自身免疫性疾病往往病程较长，需要长期关注和治疗。血管炎相关： 比如结节性多动脉炎等血管炎疾病，炎症会累及心肌的血管，影响心肌的血液供应，同时引发心肌的炎症反应，导致心肌炎发生。
药物或毒物引起
某些药物影响： 一些抗肿瘤药物，如阿霉素等，在使用过程中可能会对心肌产生毒性作用，引发心肌炎。还有抗精神病药物等，也有可能导致心肌出现炎症反应。毒物接触： 比如铅、汞等重金属中毒，会损害心肌细胞，引发心肌炎。另外，某些生物毒素，像蛇毒等，也可能造成心肌的损伤和炎症。