如果月经过后出现肚子疼、腰疼等症状，可能是由妇科疾病引起的，像盆腔炎、宫颈炎、妇科肿瘤等，也可能与泌尿系统疾病、消化系统疾病相关。女性不应擅自用药以免病情加重，应及时就医，经医生检查明确原因后进行相应治疗。
一、妇科疾病：
1.盆腔炎：若盆腔存在炎症，会致使盆腔内充血、水肿，进而引起下腹部疼痛，当炎症波及子宫底韧带时，也会导致腰疼，所以可能表现为月经过后肚子疼、腰疼，同时伴有阴道分泌物增多。经过妇科检查可明确诊断。在没有药物过敏的情况下，可在医生指导下使用头孢呋辛酯和甲硝唑联合用药进行治疗，待临床症状消失后可到医院复查。
2.宫颈炎：当宫颈局部有慢性炎症且未积极治疗时，可能发生逆行感染并波及子宫骶韧带，从而造成下腹部疼痛、腰骶部疼痛，也可能表现为月经过后肚子疼、腰疼，还可能有黏稠分泌物以及少量阴道出血。通过妇科检查明确后，医生可能给予左氧氟沙星和甲硝唑等药物治疗宫颈炎。
3.妇科肿瘤：比如子宫肌瘤或卵巢肿瘤等，随着瘤体增大，因局部受压迫，会逐渐出现下腹部疼痛及腰骶部疼痛，有时会表现为月经过后肚子疼、腰疼。通过妇科检查以及B超检查可明确诊断。若肿瘤直径大于5厘米，建议考虑手术治疗，在排除癌变的情况下，可保守治疗，并定期进行B超检查。
二、泌尿系统疾病：比如输尿管炎症或结石等，可能会产生刺激，导致月经过后肚子疼、腰疼，还可能伴有尿频、尿急、尿痛以及肉眼可见血尿。当结石活动时，尤其是肾结石，多会引起腰部放射性疼痛，而肾脏局部受炎症刺激也会引起腰疼，通过尿常规检查和B超检查可明确诊断，建议到专科进行治疗。
三、消化系统疾病：比如消化不良、肠炎、肠道肿瘤等，可能导致下腹部疼痛、腰骶部疼痛，同时会伴有大便性状改变以及大便次数增加等症状，主要是因为胃肠道炎症会使肠蠕动增加，以及在肠道肿瘤相对较大的情况下，都可能刺激后腹膜，从而有时表现为月经过后肚子疼、腰疼，建议到内科进行治疗。
总之，月经过后肚子疼、腰疼可能由多种疾病引起，女性遇到这种情况一定要及时就医，明确病因后采取合适的治疗措施，切不可盲目用药。