甲减怀孕对胎儿的影响较大。研究表明，未控制的甲减孕妇，胎儿流产风险可增加至10% - 20%左右，还可能影响胎儿神经系统发育。
对胎儿生长发育的影响
智力发育方面： 胎儿的神经系统发育在孕早期就开始，而甲状腺激素对其至关重要。如果孕妇甲减未得到控制，会导致胎儿脑发育所需的甲状腺激素供应不足，可能使胎儿出生后智力水平低于正常儿童。有研究发现，未经治疗的甲减孕妇所生婴儿，在认知功能测试中得分往往低于正常孕妇所生婴儿。身体生长方面： 甲状腺激素也参与胎儿的身体生长发育。甲减孕妇体内甲状腺激素缺乏，会影响胎儿骨骼的生长，可能导致胎儿出生时体重偏低，身体发育迟缓等情况。
对胎儿神经系统的影响
早期神经发育： 在妊娠前3个月，胎儿自身还不能合成甲状腺激素，完全依赖母体供应。若此时孕妇甲减，母体甲状腺激素不足会干扰胎儿大脑神经细胞的迁移、分化等过程。例如，会影响神经元的正常形成和连接，进而影响胎儿出生后的神经功能，如运动协调能力、语言发育等可能受到不良影响。长期神经影响： 这种早期的甲状腺激素缺乏可能会对胎儿的长期神经发育产生持续作用，即使出生后补充甲状腺激素，部分胎儿可能仍存在轻微的神经认知功能缺陷，如注意力不集中、学习能力稍差等情况。
对胎儿其他方面的影响
心脏发育： 甲状腺激素对胎儿心脏的正常发育也有作用。甲减孕妇的胎儿心脏发育可能受到影响，增加先天性心脏病的发生风险。有数据显示，甲减孕妇所生胎儿患先天性心脏病的概率比正常孕妇所生胎儿高。胎盘功能： 甲减还可能影响胎盘的功能，导致胎盘供血、供氧不足等情况，进一步影响胎儿的生长发育。例如，胎盘血流减少会使胎儿获取营养物质和氧气的量减少，不利于胎儿健康成长。